久方ぶりに

BLASTなんかしてみた。
どうしてかと言うと、siRNAの設計のため。
１つの遺伝子（厳密にいうと難しい話だが）由来の転写産物は、それこそたくさんあって機能も未知のものが多い。
例えば、ある遺伝子Aにはエキソンの２番目を含んでいるもの（a）と抜けているもの（a'）の２種類の転写産物があるとする。
ここで、エキソン２の配列を使ってsiRNAを設計すると、aはノックダウンできるけど、a'はノックダウンできないはず。
一応aが所謂遺伝子産物として、機能的な解析が様々な論文で行われていたとしても、もう１つのa'もノックダウンできた方がいいのかなー、なんて考えたり。
文献調べたりして、ちょっと考えてみますかね。