2008-01-01から1ヶ月間の記事一覧

threshold

マイクロアレイデータ解析だけではなく、いろいろな統計解析において大事なのは後の解析の対象を絞り込むためのthresholdではないかと思う。 今行っているエキソンアレイ解析では得られるデータ量が多いので、解析の様々なポイントでこのthresholdの設定が重…

月例

mac

データバックアップ。

昨日の続報

結局、3対3のトレードに(ソースはコチラ)。 坂元も三木も行ってしまうらしい。。

な、なんと

こんなニュースが。 今年のヤクルトの投手陣はどうなっちゃうの。。

6割方できた

Rで統計処理をし、Rubyでデータの整形とフィルタリング。 プログラミングについては基本的なことしかできないので、もっとうまくプログラムを組めば早く計算結果を出せるのだろうけど、とりあえずデータは出せるので自分のマシン2台をフル回転して頑張る。 …

勇退

研究所の現所長が3月いっぱいでご勇退されることに。 変わってうちの教授が所長になるそうで。

年度代表馬と特別賞

アドマイヤムーンに決定。 ウオッカはわかるけれど、メイショウサムソンが特別賞を取ったのはやはり天皇賞(春・秋)連勝によるところだろう。 個人的には天皇賞・春は好きなレースだけれど、今の競馬界で3200メートルのGIに昔ほどの重要性は感じられなくな…

できたこと

エキソンアレイの生データからgene, exon両レベルでのシグナル変換 得られたシグナルからPCA(主成分分析)を用いてデータセット中のoutliersを見つける 今後使うであろうエキソンアレイプローブと発現アレイプローブの対応テーブルの作成 対応テーブルを使…

いよいよ

自前のMacBookkuroの残りハードディスクが90Gを切ってしまった。 使い出すと結構あっという間だな。

やること

APT(Affymetrix Power Tools)を使う 必要になりそうなデータは大体揃えて成型したので、具体的な計算結果(上のを理解して)を加えて見やすくアレンジする

理解すること

Splicing Index Vallue MIDAS(Microarray Detection of Alternative Splicing) FIRMA(Finding Isoforms using Robust Multichip Analysis) 特にFIRMAが謎。google先生でもほとんど引っかからない。。

ごったがえす

今日から仕事始めの人も多いらしく、いつにも増して通勤路は混雑してる。 結局研究所の駐車場に付くまでに1時間、更に駐車場の空きスペースを見つけるのに10分余かかった。 人大杉です。

自宅にて

しばらく一人で考え事。 とりあえずRで出した結果ファイルをどうやって処理するか。 つたないながら自分でプログラムを組んで、使えるように成型するしかないのかな。 最低限必要な形のイメージはできたので、あとは実行すること。

ついでに

電話投票会員に送られてくる引換券を持って、最寄りのWINSへ。 JRA特製のパスケースを頂く。

金杯

今年の競馬もこのレースからスタート。 結果は...無念。

通常業務

今日から通常業務開始。 昨年中にどうしてもできなかったことを再度チャレンジし始める。 むむー。

のんびりと

実家から戻り、今日はのんびりと過ごす。 近所の神社にお参りに出掛け、ゆっくりとお茶をしてから帰宅。 さて、今夜は豪勢にすき焼きを食べながら、たまったビデオでも見ようかと思っていたら、ローマ帝国を舞台にした歴史もの再現ドラマをやっていて、それ…

帰宅

お正月は例年通りに実家で。 31日の朝から今日まで飲み続けて楽しく過ごした。 こうして楽しく過ごせるのも、嫁がいやな顔一つせずに実家の家事を手伝ってくれるから。 感謝感謝m(_ _)m

おめでとうございます

あけましておめでとうございます。 昨年中は皆様に大変お世話になりました。 今年は皆様の期待に添えるように邁進する所存です。 どうぞよろしくお願いします。